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Text File  |  1995-07-26  |  2KB  |  34 lines
  1. ***************************************************
  2. * Eukaryotic cobalamin-binding proteins signature *
  3. ***************************************************
  4.  
  5. In eukaryotes, a number of proteins  are involved in the binding and transport
  6. of cobalamin (vitamin B12) [1]. Some of them have been sequenced and have been
  7. shown [2,3] to  be evolutionary related and are listed below:
  8.  
  9.  - Intrinsic factor (IF).  The function of IF  is to promote the absorption of
  10.    cobalamin in the ileum by specific receptor-mediated endocytosis.
  11.  - Transcobalamin I (TC1)   (also called  R-binder  protein).  TC1  transports
  12.    cobalamin from blood to cells.
  13.  - Transcobalamin II (TC2). TC2 transports cobalamin from blood to cells.
  14.  - Haptocorrin (cobalophilin). Haptocorrin binds to cobalamin and to cobalamin
  15.    derivatives such as cobinamide.  It  may  play  a  role  in  preventing the
  16.    absorption of cobalamin analogues produced by bacteria.
  17.  
  18. These glycoproteins are polypeptides of about 400  amino acids that share many
  19. regions of  similarity. As a signature pattern, we selected a highly conserved
  20. region in their central part.
  21.  
  22. -Consensus pattern: [SN]-V-D-T-[GA]-A-[LIVM]-A-x-L-A-[LIVMF]-T-C
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: October 1993 / Pattern and text revised.
  26.  
  27. [ 1] Seetharam B., Alpers D.H.
  28.      Annu. Rev. Nutr. 2:343-369(1982).
  29. [ 2] Platica O., Janeczko R., Quadros E.V., Regec A., Romain R.,
  30.      Rothenberg S.P.
  31.      J. Biol. Chem. 266:7860-7863(1991).
  32. [ 3] Li N., Seetharam S., Lindemans J., Alpers D.H., Arwert F., Seetharam B.
  33.      Biochim. Biophys. Acta 1172:21-30(1993).
  34.